有条件的猪场，最好的办法是从脑分离菌株制作自家灭活疫苗。所谓的自家苗是指从本场发病猪分离致病毒力菌株，经实验室分离培养鉴定，大规模制备、灭活，添加免疫佐剂，并经初步试验后供本场使用的疫苗。因为血清型符合本场的实际，使用效果较好。无条件的可选用进口灭活疫苗（西班牙海博莱或勃林格）免疫母猪，初产母猪产前40天首免，产前20天二免;经产母猪产前30天免疫一次即可，一般情况下2?3周后产生保护力，母猪抗体可保护6?7周龄的仔猪；如果仔猪在8周龄以后发病，则需要在仔猪2?3周龄首免，2?3周后二免，使其产生主动免疫力。也可选用国产疫苗（武汉科前），母猪接种后可对4周龄仔猪提供保护。再用含有相同血清型的灭活苗接种小猪，对断奶仔猪产生主动保护性免疫力。由于HPS具有明显的地方性特征，血清型多，不同血清型之间无交叉保护力，目前还没有一种灭活苗同时对猪所有的致病株产生交叉保护力，商品疫苗效果有时不确定。也可试用常规的本场的病变组织匀浆制成的自家组织灭活苗。
